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Le séquençage de l'ADN ancien (aDNA) offre une occasion unique de récupérer des informations génétiques provenant d'espèces disparues. Outre la résolution de questions phylogénétiques concernant l’évolution, l’origine, les phénomènes d’hybridation, les relations entre espèces ou populations, les processus de domestication et d’amélioration, l’aDNA peut offrir de nouvelles pistes pour traiter un certain nombre de problèmes liés à l’adaptation et à la diversification des espèces modernes. Beaucoup demeure à apprendre à partir de L'aDNA d’espèces ancêtres, de leur propagation et de leur adaptation locale en dehors de leur zone de domestication indigène. En particulier, la possibilité d'obtenir des estimations fiables de la trajectoire allélique dans pratiquement n'importe quel locus génomique au cours des grandes transitions climatiques survenues dans le passé ouvre la voie à l'identification des variants génétiques qui sous-tendent l'adaptation à de nouvelles contraintes environnementales. Ces loci pourraient représenter des cibles prioritaires pour les sélectionneurs pour identifier les meilleurs (polymorphismes) candidats à ré-introduire dans le pool moderne cultivé.

Scientific insights gained from plant aDNA, as exemplified by wheat. The geological periods are indicated at the top (orange arrow) above the associated temperature profiles (blue curve) and key climatic changes. The known historical routes of wheat migration from the site of origin (Fertile Crescent) are indicated by green arrows: westwards via an inland route (through the Balkans to Central Europe) or along a coastal path (via Anatolia to the Mahgreb and Iberian peninsula); or eastwards via routes to the north and along the Inner Asian Mountain Corridor. Major migration phases are shown in different colors on the time scale. Diploid, tetraploid and hexaploid wheats are depicted as colored circles (green, red and blue colors) with mixed colors reflecting hybridization events. Wheat aDNA offers the opportunity to investigate the impact of migration, translocation, extinction and hybridization events in shaping the modern genetic diversity and in driving adaptation to environmental constraints (temperature variation) over 10,000 years of domestication and cultivation.

Référence principale du groupe :
Pont C, Wagner S, Kremer A, Orlando L, Plomion C, Salse J (2019b) Paleogenomics: reconstruction of plant evolutionary trajectories using modern and ancient DNA. Genome Biol. doi.org/10.1186/s13059-019-1627-1