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Dernière mise à jour : Mai 2018

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UMR GDEC

UMR 1095 Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales

2. Aptitude au croisement du blé avec les espèces apparentées (seigle)

Véronique Lesage (coordinatrice), P. Sourdille, M-C. Debote, B. Charef, A. Loussert

skr Les travaux réalisés précédemment (Alfares et al, 2009) nous ont permis de mendeliser le QTL majeur de crossabilité Skr localisé dans la partie distale du bras court du chromosome 5B, de réaliser une cartographie fine dans une population HIF (Heterogeneous inbred family) de 233 individus et d'encadrer le gène par des marqueurs moléculaires dans un intervalle de 4cM, d'initier une carte physique dans la variété crossable Chinese Spring et d'établir les relations de synténie avec le riz et brachypodium dans la région. Le clonage positionnel du gène devrait intervenir dans les prochains mois dans le cadre d'un projet innovant et d'un postdoctorat financé par le département BAP (Génétique et Amélioration des Plantes) de l'INRA. La carte physique du locus dans la variété crossable Chinese Spring est en cours de complétion et une carte de la variété non crossable Courtot est en cours de construction en collaboration avec le CNRGV (Coll. H. Bergès) afin d'anticiper une délétion possible dans la variété crossable.

Le séquençage des BACs couvrant la région du gène devrait permettre de développer de nouveaux marqueurs et de restreindre l'intervalle génétique pour identifier des gènes candidats. Une fois le ou les gènes candidats identifiés, la validation fonctionnelle sera réalisée par transformation d'une lignée SSD (single seed descent) crossable et par RNAi sur Courtot (non-crossable). Une fois le gène isolé, nous envisageons d'étudier son évolution au sein des différents pools de blé tant d'un point de vue géographique (la crossabilité n'est retrouvée chez le blé tendre que dans le pool asiatique) que d'un point de vue temporel (comparaison entre diploides, tetraploides et héxaploides) en collababoration avec l'équipe DGS pour mieux comprendre l'origine de l'inhibition à la crossabilité interspécifique. Ce projet est également focalisé sur la compréhension du mode d'action du gène SKr au travers d'analyses fonctionnelles et physiologiques. Nous souhaitons réaliser des constructions de type promoteur de Skr-gène marqueurs (GUS, GFP) afin d'étudier finement l'expression spatio-temporelle du gène dans des plantes transformées. Par ailleurs, nous envisageons également d'analyser la localisation subcellulaire de cette protéine en lui associant une étiquette. Finalement, ces connaissances et ressources seront exploitées pour augmenter le panel de blé élites pouvant être croisés avec des espèces apparentées dans le but d'élargir les bases génétiques du blé pour la sélection.