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UMR GDEC

UMR 1095 Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales

SEVEN

Structure et Evolution du Génome du Blé

21chr

Les objectifs de l'équipe SEVEN sont :

  • Etudier l’organisation et l'évolution du génome du blé, comprendre les relations entre la structure du génome, l'épigénome, l'expression des gènes, et la dynamique évolutive
  • Développer de nouveaux outils pouvant être utilisés, directement ou indirectement, dans les programmes d’amélioration variétale

Le projet scientifique s'appuie sur la production, ces dernières années, de ressources génomiques d'intérêt majeur :

  • La séquence de référence des chromosome 3B publiée en 2014 (Choulet et al. Science 2014)
  • La séquence de référence des chromosomes 1B et 4B en cours de production (en collaboration avec le Genoscope, projet FranceGenomique)
  • Des données de re-séquençage du chromosome 3B chez d'autres variétés de blé tendres et chez d'autres espèces de Triticeae
  • Une ébauche de séquence du génome complet produite par le consortium international IWGSC (IWGSC Science 2014)
  • Des marqueurs moléculaires SNP saturants le génome
  • Des programmes bioinformatiques et bases de données dédiés aux analyses de séquences

Activités de l'équipe :

1. Séquençage du génome du blé tendre

Objectif : Produire une séquence de référence du génome du blé tendre
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2. Analyse de l'espace génique

Objectif : Mieux comprendre l'organisation et l'évolution du contenu en gènes, et les relations entre structure du génome et expression
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3. Dynamique des Elements Transposables

Objectif : Comprendre l'impact des ET sur la dynamique du génome du blé
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4. Epigénomique du blé tendre

Objectif : Caractériser et comprendre le rôle des marques épigénétiques dans la régulation de l'expression des gènes chez le blé
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5. Développement d'outils génomiques pour la sélection variétale

Objectif : Développer des marqueurs moléculaires et de nouveaux outils pour le génotypage à haut-débit
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